Primer Synthesis Services
引物合成服务
引物合成服务

引物合成在分子生物学研究中起着重要的作用,它的基本原理是基于固相合成技术,通过逐个添加碱基来构建所需的引物序列,并通过纯化和验证确保引物的质量和纯度。


目前引物合成基本采用固相亚磷酰胺三酯法,是将DNA固定在固相载体上完成DNA链的合成的,合成的方向是由待合成引物的3′端向5′端合成的,相邻的核苷酸通过3′→5′磷酸二酯键连接。亚磷酰胺三酯法合成DNA片段,具有高效、快速的偶联以及起始反应物比较稳定的特点。


  • 纯化方式介绍选择
  • 常见修饰物的应用
纯化方式纯化原理优点缺点适用范围
DSL纯化采用最新的biolytic气象氨解仪,在高纯氨气水蒸汽混合物的气相氨解环境下将连接在CPG上的引物切割洗脱下来,能有效地去除盐分,经过有机溶剂的梯度洗脱能去除部分的杂质。相比传统的液相氨解高效,快速,无交叉污染,所有纯化方法中最简单的一种。不能有效去除比目的片段短的小片段,前提是合成效果很好时才能选用此法。PCR扩增、亚克隆、点突变、全基因合成及DNA测序等。
OPC纯化利用OPC柱中装有对DMT基团具有特殊亲和力的树脂,合成DNA片段时保留5’端最后一个碱基上的DMT,所有合成产物吸附在OPC柱上以后,用稀的有机溶剂洗柱,带有DMT片段的吸附能力强,不易被洗脱,不带有DMT的片段吸附能力弱从而被洗脱,然后用酸脱去吸附在OPC柱上DNA的DMT,再用浓一点的有机溶剂洗脱DNA。方便、快捷其专一性吸附DMT能力有限,不免仍然有短片段带入的可能,而且负载量小,特别是对长于40个碱基以上的 片段纯化效果不好。PCR,引物的关键在于5′序列 如限制性酶切位点;指定位点突变;合成文库时的第一条链cDNA合成;克隆接头的产生。
PAGE纯化利用不同长度序列DNA在凝胶中迁移率不同来分离目标序列和失败序列,从而提供高纯度的目标引物。 对长链引物(大于40 mer)的纯化特别有效。本公司采用和C18反相柱连用,毛细管电泳,纯度大于85%。纯化效果好,尤其是纯化长链效果好。自动化程度低,纯化过程中引物损耗较大,发货周期相对较长。40 mer以上的普通引物的纯化最有效方式;用于定点突变、克隆;蛋白结合凝胶迁移电泳分析、治疗与诊断用途。
HPLC纯化HPLC根据吸附介质分为反相柱和离子柱。反相柱是根据疏水性的差别来分离的,即疏水性更强的长片段比短片段吸附能力更强,后出峰;离子柱上根据不同长度寡核苷酸带有不同净电荷,较长的片段带有高电荷比带有电荷低的短片段在离子柱内流动得慢,从而依次将不同片段洗脱出来。自动化程度高,省人力,纯化效果好,纯度可达 99%以上,特别是在标记引物和特殊修饰探针纯化中效 果好。纯化量小,不能纯化长片段,设备昂贵。<50 mer的普通引物的纯化,用于定点突变、克隆、蛋白结合凝胶迁移电泳分析、治疗用途;修饰引物的纯化;商业化的诊断引物或探针。
磷酸化
Phosphoryl
5’磷酸化可用于接头、克隆和基因构建以及连接酶催化的连接反应。 磷酸化可抗外切酶消化的相关实验中,也用于阻止DNA聚合酶催化的DNA链延伸反应。
生物素
Biotin
生物素修饰能够耐受热和pH。生物素化的DNA能够成功的转化进入细菌 。 引物生物素标记,可用于非放射性免疫分析来检测蛋白质、胞内化学染色、细胞分离、核酸分离、杂交检测特异性的DNA/RNA序列、离子通道构象变化等。
地高新
Digoxigenin
地高新是一种从毛地黄植物分离出来的类固醇物质,因为毛地黄植物的花和叶子是这种物质唯一自然来源, 所以抗地高新抗体不会结合到其他生物物质。地高新经由一个11个原子的间臂连接到脲嘧啶的C5位置。杂交的地高新探针可以由抗地高新抗体来检测, 这个抗体一般会与碱性磷酸酶,过氧化物酶,荧光素或胶体金偶连。或者没有偶连的抗地高新抗体但偶连的抗抗体。 地高新标记的探针可用于各种杂交反应,如DNA-DNA杂交(Southern blotting),DNA-RNA杂交(Northern blotting)斑点杂交(Dot blotting ), 克隆杂交,原位杂交以及酶联免疫分析(ELISA)。
内部氨基修饰主要用C6-dT aminolinker来加到胸腺嘧啶残基上来进行内部修饰。修饰后氨基与主链相距10个原子距离,可用于进一步的标记和酶连接(如碱性磷酸酶)。
5'氨基修饰可用于制备功能化的寡核苷酸,广泛应用在DNA芯片(DNA Microarray)和多重标记诊断系统。目前提供5' C6 氨基修饰和5' C12氨基修饰两种, 前者可用于连接一些即便靠近寡核苷酸也不会影响其功能的化合物,后者用于亲和纯化基团的连接和一些荧光标记,尤其是当荧光可能会因标记太靠近DNA链而被淬灭时。
3'氨基修饰可用于制备功能化的寡核苷酸,广泛应用在DNA芯片(DNA Microarray)和多重标记诊断系统。目前提供5' C6 氨基修饰和5' C12氨基修饰两种, 前者可用于连接一些即便靠近寡核苷酸也不会影响其功能的化合物,后者用于亲和纯化基团的连接和一些荧光标记,尤其是当荧光可能会因标记太靠近DNA链而被淬灭时。
Spacer5'-巯基在很多方面与氨基修饰类似。巯基可用于加附各种修饰如荧光标记物和生物素。 例如可以在碘乙酸和马来酰亚胺衍生物存在下来制作巯基连接的荧光探针。 5'的巯基修饰主要用5'巯基修饰单体(5'-Thiol-Modifier C6-CE Phosphoramidite 或Thiol-Modifier C6 S-S CE Phosphoramidite)。 用5'-Thiol-Modifier C6-CE单体修饰后必须进行硝酸银氧化以去除保护基(trityl),而Thiol-Modifier C6 S-S CE单体修饰后须用DTT将二硫键还原成巯基。
硫代
Phosphorothioate
硫代修饰的寡核苷酸主要用于反义实验中防止被核酸酶降解。 您可以选择全硫代,但随着硫代碱基的增加,寡核苷酸的Tm值会降低,为了降低这种这种影响, 可以对引物两端2-5个碱基进行硫代修饰,通常可以选择5'和3'各3个碱基进行硫代修饰。
脱氧脲嘧啶
DeoxyUridine,dU
脱氧脲嘧啶可以插进寡核苷酸来增加双链的熔点温度从而增长双链的稳定性。 每个脱氧胸腺嘧啶被脱氧脲嘧啶替代可以增长双链熔点温度1.7 ℃。
脱氧次黄嘌呤
deoxyInosine,dI
脱氧次黄嘌呤是一个自然存在的碱基, 虽然不是真正意义上的通用碱基但当与其它碱基结合时会比其它碱基错配相对更稳定。 脱氧次黄嘌呤与其它碱基的结合能力为dI:dC > dI:dA > dI:dG > dI:dT. 在DNA聚合酶的催化下,脱氧次黄嘌呤首选与dC结合。
服务优势
  • 严苛的质控标准

    严苛的质控标准

  • 出货、发货速度快

    出货、发货速度快

  • 高灵敏度和高准确度

    高灵敏度和高准确度